TBE finns förutom i Sverige spritt i Mellan- och Sydeuropa (ex Baltikum, Österrike, Tjeckien) samt i ett område över centrala Finland-Ryssland (Tajga-fästingen). I Sverige sker 300-400 fall årligen (2018 – 385, 2019 – 359), enligt Folkhälsomyndigheten.
I Sverige sker merparten av smittotillfällena i Östersjökusten (Sörmland, Stockholms och Upplands skärgårdar) men numer har riskområdena utökats till områden kring Vänern och Vättern men även västkusten (Göteborg Götaälvdal).
Risken för smitta är från april till november då fästingar är som aktivast. I vissa områden kan upp till 5% av fästingarna vara smittade av TBE.
Män smittas oftare än kvinnor.